在月经周期中，子宫内膜会逐渐增厚和充血，为迎接受精卵作好准备。假如卵子没有受精，子宫内膜会分解脱落，形成月经。但有小部分子宫内膜或会在子宫外面的器官生长，形成子宫内膜异位。异位的子宫内膜和正常的子宫内膜一样，每月都会经过上述的周期性变化；但这些子宫内膜有时会肿胀和出血，让血液流到体腔内，令患者发炎和感到痛楚。同时，一些称为黏连的疤痕组织可能会因而形成，把身体器官和组织连结在一起，影响身体器官的正常运作。
最常出现子宫内膜异位的地方是卵巢丶把卵子由卵巢输送到子宫的输卵管，以及一些将子宫固定於适当位置上的组织。卵巢的子宫内膜异位可形成肿囊，即子宫内膜瘤。肿囊内有棕色液体，所以又叫「朱古力瘤」。它们不会引起痛楚，因此只能在一些检查生育能力的身体检查中发现。万一肿囊破裂，肿囊内的液体会流进体腔，导致剧痛和形成黏连。较罕见的子宫内膜异位可在膀胱丶肠道或其他器官出现。
子宫内膜异位的成因至今未明，也没有人知道为何子宫内膜异位只会在某些女性身上出现的原因。有些人相信，那是因为月经未有经由阴道流出体外，而经由输卵管倒流至卵巢所致。
子宫内膜异位可在任何介乎生育年龄的妇女身上发生，也可以由家族遗传。白种人患子宫内膜异位的机会比其他种族的人为高，而30岁後才首次生育以及不育的妇女，有更大机会患有子宫内膜异位。
子宫内膜异位最常见的病徵是近似经痛的盆腔痛，而个别病徵则因人而异。有些子宫内膜异位的患者可能没有任何病徵，而有些患者却会感到剧痛难当，她们通常会在经期前後感到痛楚；而有些患者则会长期感到盆腔痛。痛楚可能会集中在身体其中一旁丶中间或散布在身体两旁。有些患者在来经前或经期中性交会感到痛楚。另外，患者的经期也可能会出现变化，例如她们在经期前会有轻微出血（滴血）丶月经失衡或经血过量等现象。肠道或膀胱的子宫内膜异位可引致下腹肿胀丶如厠时疼痛或经期时粪便带血。可是，子宫内膜异位的病徵通会常在怀孕期间或停经後消失。对於某些妇女，患上子宫内膜异位的第一个表徵就是难於成孕。
由於子宫内膜异位没有明显的病徵，所以检查腹腔的内部情况，是确定妇女是否患上子宫内膜异位的唯一方法。这项检查需要在医院进行，医生会将一个名为腹腔镜的幼金属探望管，经肚脐下方的皮肤插入腹腔内。这检查一般会在全身麻醉的状态下进行，由妇科医生负责。在某些情况下，医生会取出小部分异位的子宫内膜作检验。检查需时约30分钟，病人一般无需留院。
治疗子宫内膜异位的目的包括：
治疗方式主要取决於患者的年龄丶病徵的严重程度丶患者是否希望生育孩子以及病情是否严重等。对於大部分没有接受治疗的患者，子宫内膜异位的情况通常会维持不变或有所改善。可是，在每3个患者中，约有1个的病情会恶化。因此，患者必须与医生商讨病情，并共同寻求治疗的对策。药物对治疗轻微的子宫内膜异位或有帮助；而病情较严重的则可能需要动手术。有时医生可能需要把病人的子宫移除，又或移除一个甚至两个卵巢。
止痛剂 ─ 例如扑热息痛丶抗发炎剂及可待因，都有助缓和轻微痛楚。
辅助疗法 ─ 如针炙丶香薰疗法丶草药疗法和顺势治疗等，也可能有帮助。
子宫内膜细胞就好像正常的子宫内膜一样，需要雌激素来维持生命和生长。因此，一些能降低体内雌激素水平的激素药物，可帮助缩小子宫内膜异位。激素药物有多种可供选择，包括：
以上所有激素性药物的作用大致相同，但各有不同的副作用。医生可能会建议病人试服数种药物，以找出哪一种最为有效以及带给患者最少副作用。
当服用激素药物时（口服避孕药除外），病人应同时采用阻碍性避孕法（如使用避孕套），因为药物可损害发育中的胎儿。 使用药物不可治愈子宫内膜异位，病徵通常在停服药物後再出现。在每5个女性中，约有2个在停用药物的12个月後会再感到痛楚，约有一半则会在5年後再次出现疼痛的情况。
手术旨在尽量清除异位的子宫内膜，同时不损女性的生育能力。如有以下情况，病人便应接受手术：
每5个子宫内膜异位的患者中，约有1人会在接受手术5年後病情复发。医生通常会在手术後为病人处方激素药物，以延迟病情复发。可是，现时唯一能够完全阻止子宫内膜异位复发的方法，是切除病者的卵巢。病情严重的患者在不得已的情况下才会考虑这个办法。而切除卵巢的手术也可用於不打算生育的妇女。
子宫内膜异位有机会使女性不育。严重的子宫内膜异位可能是由输卵管受阻塞引致，但轻微的子宫内膜异位也可减低生育能力。治疗子宫内膜异位的药物不会改善妇女的生殖能力，但如果因为子宫内膜异位损害子宫和卵巢的正常运作而需接受手术，这便可改善生殖能力。患有子宫内膜异位的女性如希望生育，可能需要接受生育治疗。
